中国板栗高密度遗传图谱构建与坚果性状QTL定位研究取得新进展-林果业生态环境功能提升协同创新王保长歪传

近日时怀婵,中心秦岭教授、曹庆芹教授团队对中国板栗高密度遗传图谱构建与坚果性状QTL定位研究取得新进展。相关成果以“Construction of a SNP-BasedHigh-Density Genetic Map Using Genotyping by Sequencing (GBS) and QTL Analysisof Nut Traits in Chinese Chestnut (Castanea mollissimaBlume)”为题发表在《Frontiers inplant science》(Feiyang, Ji.吸星宝典 , 2018, doi: 10.3389)。该论文的第一作者为北京农学院硕士研究生纪飞杨二翁登泰山。
该团队选取中国板栗‘燕山早丰’和‘官厅10号’以及259个F1代杂交群体凡人修真传,基于GBS技术开发SNP标记,构建板栗高密度遗传图谱二婚不愁嫁。通过连续三年的表型数据观察姜马陆,进行了成熟期和坚果大小性状的QTL定位,结果如下:父本‘官厅10号’的遗传图谱包含1318个SNP标记陆川生活网,图谱总长768.86 cM,相邻标记间平均距离为0.58 cM;母本‘燕山早丰’的图谱包含1769个SNP标记,图谱总长750.52 cM丑皇后 ,相邻标记间平均距离为0.42 cM;整合图谱2620个SNP标记分布在12个连锁群上,图谱总长为1078.06 cM迷幻蓝调 ,相邻标记间平均距离为0.41 cM临县吹打 。
本研究构建的整合图谱是目前栗属植物中密度最高的遗传图谱。同时定位到17个与坚果性状相关的QTL位点,分布在LG A,LG B,蒙特利尔事件LG H,LG I,LG K和LG L连锁群上,表型贡献率的分布范围为9.1-16%,LOD值的分布范围为3.65- 4.93%。其中qNT-I-1和qRP-B-1被认为是主效的QTL位点。该研究旨在通过中国板栗F1代杂交群体路玉婷 ,基于GBS测序技术,在全基因组水平上开发SNP标记,并构建中国板栗的高密度遗传连锁图谱,为板栗基因组比较分析、基因组组装及遗传育种研究奠定基础。
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